В классе, производном от UIWebView, реализуйте эти методы:
- (void)webView:(id)sender runJavaScriptAlertPanelWithMessage:(NSString *)message initiatedByFrame:(id)frame {}
- (BOOL)webView:(id)sender runJavaScriptConfirmPanelWithMessage:(NSString *)message initiatedByFrame:(id)frame { return NO; }
Хотя это не строго задокументировано, вы на самом деле ничего не вызываете, поэтому это может быть принято.
В противном случае вы будетедолжен найти javascript на загруженной странице, которая выдает предупреждение, и удалить его.