я хочу запустить команду mysql START SLAVE; Возможно ли это сделать?
Пока мастер правильно настроен, можно перезапустить подчиненные. Они автоматически перезапустят «START SLAVE» при перезапуске.
Я думаю, что если есть ошибки репликации, вам, возможно, придется исправить их или сбросить репликацию до перезапуска ведомых.
http://dev.mysql.com/doc/refman/5.0/en/start-slave.html