Сняли ли вы флажки в настройках
Сервис -> Свойства обозревателя -> Дополнительно -> Просмотр [заголовок] -> Снимите флажок «Отключить отладку сценариев (Internet Explorer)» и снимите флажок «Отключить отладку сценариев (другое)»
Иногда вам нужно перезапустить браузер, чтобы VS2008 узнал, что он внес некоторые изменения.
Вы пытались вставить "отладчик"; ключевое слово в ваш файл JavaScript? Это обычно никогда не подводит меня.
Если у вас IE8, вы можете отлаживать прямо в самом браузере.