Том -
Вероятно, самый простой способ сделать это - открыть проект в IDE, установить нужные параметры в IDE и затем сохранить.
Еще лучше было бы настроить конкретную конфигурацию сборки для этих параметров и использовать ее.
В среде IDE используется сам MSBuild, поэтому все параметры, заданные в среде IDE, сохраняются в* .DPROJ файл (или GROUPPROJ, в вашем случае), и поэтому, когда вы выполняете командную строку, используются те же самые настройки, которые были установлены в IDE.Если вы используете конкретную конфигурацию сборки для этого конкретного набора параметров, вы можете просто вызвать эту конфигурацию в командной строке, и вы получите то, что хотите.
Другими, более короткими словами: пусть IDE сделает всю работу за вас.