Я не думаю, что это возможно, и даже если это возможно, то, на мой взгляд, это очень плохое решение.
Я думаю, что ваш лучший вариант - создать модель ProjectMembership с двумя FK,один для пользователя и один для проекта.Тогда у вас есть ручное отношение M2M, и вы не можете использовать все приятные функции Django для работы с отношениями M2M.
Если вы, однако, хотите, чтобы эти функции (они не нужны)тогда вам следует изменить либо модель пользователя, либо модель проекта.