Невозможно «выйти» в системный трей, должен быть запущен процесс с очередью сообщений, чтобы значок отображался в трее и работал правильно (например, не исчезал при наведении на него курсора)
Способ, которым Adobe и другие справляются с этим, состоит в том, чтобы иметь отдельное приложение, которое просто делает значок в системном трее, когда вы щелкаете по нему, и ваше приложение не запускается, оно запускает его, если приложение уже запущено, оно переносит его впередний план.