Если я правильно понял ваш вопрос, вам понадобится слой vector для отображения закладок:
var my_bookmark_layer = new OpenLayers.Layer.Vector(
"Bookmarks",
}, {
displayInLayerSwitcher: true
});
map.addLayer(my_bookmark_layer);
Это добавит пустой слой, который вы сможете использовать позже.
Чтобы получить координату из карты, см. этот пример в папке примера OpenLayers.
Затем вам нужно будет сохранить координату как объект в слое закладок.
Надеюсь, это поможет:)