В случае, если это поможет кому-то еще.Мне удалось заставить NCover 1.5.8 (тот, который поставляется с TestDriven.NET) работать хорошо с nunit.
NCover.Console.exe nunit-console-x86.exe /noshadow yourAssembly.dll
Единственная хитрость была в том, чтобы убедиться, что COM-компонент CoverLib.dll правильно зарегистрирован
regsrv32 CoverLib.dll
В противном случае вы получите ошибку «Профилированный процесс завершен», а затем убедитесь, что мы передаем параметр / noshadow параметру nunit, иначе NCover не сможет загрузить символы для сборки (по крайней мере, в моем случае).