В R Как загрузить разреженную матрицу, отформатированную на рынке матриц, в dgCMatrix?

Question

Я пытаюсь использовать пакет Matrix для чтения файла в формате MatrixMarket, но я получаю обратно ngTMatrix. Я не могу конвертировать его, так как нет способа конвертировать ngTMatrix в dgCMatrix. Преобразование его в не разреженную матрицу не вариант, так как он слишком большой. Есть предложения?

Answer 1

Я не уверен, почему у вас возникли проблемы, потому что вы можете использовать as() для принудительного ngTMatrix к ngCMatrix:

> pm <- as(as.integer(c(2,3,1)), "pMatrix")
3 x 3 sparse Matrix of class "pMatrix"

[1,] . | .
[2,] . . |
[3,] | . .

> pm.t <- as(pm, 'ngTMatrix')
> pm.c <- as(pm.t, 'ngCMatrix')

> class(pm.c)
[1] "ngCMatrix"
attr(,"package")
[1] "Matrix"

> class(pm.t)
[1] "ngTMatrix"
attr(,"package")
[1] "Matrix"