при работе с большими объемами данных в тарифах innodb лучше, чем myisam.,
http://www.mysqlperformanceblog.com/2007/01/08/innodb-vs-myisam-vs-falcon-benchmarks-part-1/
и
http://www.cftopper.com/index.cfm?blogpostid=84
Джеймс Дэй, инженер поддержки MySQL и инженер Википедии, рекомендует людям постоянно использовать InnoDB, если только по какой-то причине не станет очевидно, что вам нужен MyISAM:
"Я бы пошел с InnoDB, пока не было доказано, что это не подходит. Первая причина - надежность. Получите сбой с MyISAM, и у вас будет ненадежный и медленный процесс, связанный с размером таблицы, процессом восстановления таблицы. То же самое с InnoDB и вместо этого вы получаете фиксированное время, быстрый и надежный процесс применения / отката журналов. По мере того, как набор данных увеличивается, это становится все более и более важным, как и в случае, если вы хотите делать что-то вроде сна, а не просыпаться в середине ночь починить разбитый стол.
Для надежности и производительности мы используем InnoDB практически для всего в Википедии - мы просто не можем позволить себе простои, связанные с использованием MyISAM, и проверяем таблицу на 400 ГБ данных при сбое. "