Я бы не стал этого делать, потому что, насколько я знаю, VisualSVN имеет собственный веб-сервер (Apache) и двоичные файлы SVN.Я ожидал бы проблем с блокировкой при запуске двух из каждого репо, если это вообще возможно.VisualSVN, вероятно, вообще не будет устанавливаться дважды.
Это похоже на случай отдельной установки SVN и Apache и пользовательской конфигурации.Я не могу сказать, возможно ли то, что вы хотите, но я ожидаю, что это так.Это, вероятно, должно быть неудобно - VisualSVN убирает много хлопот конфигурации, которые вы испытываете при выполнении настройки вручную.Вопросы об этом было бы целесообразно задать на Serverfault.com.
Помимо VisualSVN, существуют и другие, также коммерческие упаковщики.Возможно, один из них более гибок в этом отношении.
Обновление : также проверьте это: Поддержка нескольких методов доступа к репозиторию из книги SVN