Вам нужно сделать svn copy, а затем svn delete (если вы хотите полностью удалить trunk1).Это сохранит всю историю из trunk1 в новом trunk2.Только svn copy сохранит историю исходного местоположения.
Причина, по которой это происходит, заключается в том, что некоторые внутренние операции svn move с самых первых дней развития Subversion.Это то, что сообщество разработчиков Subversion хочет исправить, но для исправления потребуется много работы.Это готовится к выпуску 2.0, который может долго отсутствовать.