Пометьте поля для пропуска с ключевым словом 'transient'. Пример на основе вашего кода:
public class Foo
{
public transient int a;
public String b;
public Bar boo;
public Foo(int a, String b, Bar c)
{
this.a = a;
this.b = b;
this.boo = c;
}
}
Свойство a не будет сериализовано в XML.