Ну, я заметил, что в файле sqlite есть ошибка, которую я использую для заполнения NSPersistentStoreCoordinator.В таблице Z_PRIMARYKEY этого файла sqlite некоторые поля Z_MAX были установлены в 0, но должны были быть равны 1. Когда я это исправил, он избавился от ошибки, описанной выше.