При использовании Hibernate объекты загружаются в постоянный контекст, называемый session, и такие изменения, как создание, обновление, удаление постоянных объектов, фактически вносятся в память. Если вы хотите или должны синхронизировать состояние в памяти с базой данных, чтобы сделать изменения постоянными, вам нужно flush session, чтобы Hibernate генерировал соответствующие операторы SQL вставки, обновления, удаления.