Другой подход заключается в добавлении свойства перекрытия на график.Допустимые свойства: масштабирование (что значительно увеличит размер вывода) или ложь (что не приведет к значительному увеличению размера, но, вероятно, приведет к тому, что ребра будут перекрывать узлы).
overlap = scale;
Если выиспользуя overlap = false, вы можете избавиться от перекрытия ребер с узлами, добавив атрибут splines=true:
overlap = false;
splines = true;
Это заметно замедлит время генерации для больших графиков.