Шаблон Window-based Application
предоставляет только делегат приложения и окно.
A View-based application
откроет вам делегат приложения и окно, а также представление.
Ваше приложение не показывает окно, потому что представление, которое вы (скорее всего) просматриваете и редактируете сейчас, загружается окном, которое находится в отдельной XIB.