Этот код сделает это:
var el = new XElement(
"Activity",
new XAttribute(XName.Get("Class", "SomeNamespace"), "WorkflowConsoleApplication1.Activity1"),
new XAttribute(
XName.Get("VisualBasic.Settings", "SomeOtherNamespace"),
"Assembly references and imported namespaces for internal implementation"));
Console.WriteLine(el.ToString());
Обратите внимание, как вы не указываете префиксы, а скорее пространства имен, к которым принадлежат эти атрибуты. Это разработано и соответствует спецификации XML. Префиксы будут генерироваться автоматически или извлекаться из содержащего элемента, если этот элемент является дочерним для другого элемента, который уже определил префикс для используемых вами пространств имен.