ALTER TABLE <YourTable, sysname, Emp>
ADD CONSTRAINT <YourConstraintName, sysname, uix>
UNIQUE NONCLUSTERED (EmpID,DeptID)
(Вставить в SSMS и использовать (CTRL + Shift + M))
Или сделать это при создании таблицы и, как это звучит, как будто нет альтернативного использования ключа.
CREATE TABLE EMPLOYEE_DEPARTMENT(
EmpID int NOT NULL REFERENCES EMPLOYEE(EmpID),
DeptID int NOT NULL REFERENCES DEPARTMENT(DeptID),
CONSTRAINT PK_EMPLOYEE_DEPARTMENT PRIMARY KEY CLUSTERED (EmpID ASC,DeptID ASC)
)