Я думаю, вам нужно что-то вроде этого:
<s:iterator value="classifications" status="theStatus" id="c">
<s:if test="#c.parentID == -1">
<p>-1: <s:property value="#c.subjectName" /></p>
</s:if>
<s:else>
<p>not -1: <s:property value="#c.subjectName" /></p>
</s:else>
</s:iterator>
В зависимости от того, какую версию распорок вы используете, вам может потребоваться изменить атрибут id на var в теге итератора.