Я понял это.
1) Вам необходимо установить размер всплывающего окна:
myUIPopupController.PopoverContentSize = new SizeF (1024f, 1024f);
2) Затем установите всплывающее окно на основе относительного размера кадра:
myUIPopupController.PresentFromRect (relativeFrame, this.SplitViewController.View, UIPopoverArrowDirection.Right, true);