Отладка Java обычно происходит через сетевое соединение. Если все, что у вас есть, это последовательный порт (который предоставляет COM-порт), то вы должны подключить сеть TCP / IP через последовательный порт FIRST. Обычно это делается с помощью PPP или SLIP, что само по себе довольно интересное упражнение.