Последние версии базы данных magic_mime могут без проблем идентифицировать файлы mkv / wmv.Подобно тому, как ваш общий хост имеет древнюю версию базы данных.
Вы можете принудительно использовать другой файл базы данных (с включенными определениями mkv / wmv), выполнив:
$handle = finfo_open('FILEINFO_MIME_TYPE', '/path/to/updated/database/file').
Вы должны быть в состоянии извлечь обновленный файл базы данных из пакета fileinfo-type для дистрибутива Linux.