Я написал для вас небольшой форматировщик в Ruby. Сохраните его как файл .rb и используйте его через CLI, например ruby format.rb input.css input-clean.css:
#Formats CSS
input, output = ARGV
#Input
if input == nil or output == nil
puts "Syntax: #{$0} [input] [output]"
exit
end
#Opens file
unless File.exist? input
puts "File #{input} doesn't exist."
exit
end
#Reads file
input = File.read input
#Creates output file
output = File.new output, "w+"
#Processes input
input = input.gsub("{", "\n{\n\t")
.gsub(",", ", ")
.gsub(";", ";\n\t")
.gsub(/\t?}/, "}\n\n\n")
.gsub(/\t([^:]+):/, "\t" + '\1: ')
#Writes output
output.write input
#Closes output
output.close