3000 файлов будут в порядке, 300 000 файлов, и у вас возникнут проблемы:)
Единственный способ узнать наверняка - это измерить!
Создание папок с 10 файлами нулевой длины, 100 файлов 1000 файлов. , , 10000000.
Затем измерьте время, которое требуется, чтобы найти файл в каждой из папок, и вы получите более точное представление о «слишком медленном».
P.s. «Слишком медленно» совершенно субъективно. 10 мс слишком медленно или 10 миль слишком медленно?
Вам нужно решить, что такое "Слишком медленно", и работать оттуда.
P.P.S Тщательно подумайте, прежде чем принимать решение об использовании файловой системы таким образом, есть лучшие альтернативы (как показано в других разделах).