Обычно у вас не было бы никаких проблем.У меня были ActivePerl и Strawberry, оба доступны в PATH в течение некоторого времени.Я скопировал Perl.exe из Strawberry в файл с другим именем и назвал его.Но у вас будут проблемы с такими утилитами, как "cpan" или "ptar" в Perl, который находится дальше от PATH, вам нужно будет вызывать их только из каталога bin.
PS Все проблемы не будут постоянными.
PPS Сделайте резервную копию ActivePerl, и вы всегда сможете восстановить ее.