FTP имеет два открытых порта, один для команд и один для передачи данных.Так как вы хотите только выполнить команду, вам не нужно использовать ftp, но вы можете использовать протокол telnet.
Протокол ftp в Rebol2 не поддерживает специфичные для сайта команды, такие как chmod.Тем не менее, я написал свой собственный протокол ftp для Rebol3 (см. http://github.com/gchiu/Rebol3/tree/master/protocols/), и похоже, что для добавления команды SITE требуется всего несколько строк.