Рекомендую:
schroot -c name -u root sh -c "export A=3 && export B=4"
Это запускает оболочку с опцией '-c', указывающей ей (оболочке) прочитать следующий аргумент как команду (сценарий), которую нужно выполнить. Тот же метод работает с другими аналогичными командами: 'su', 'nohup', ...