Я бы использовал что-то вроде xcopy, как рекомендовано, однако я бы использовал флаг даты, чтобы указать только копирование новых файлов. Просто пропустите дату, и она будет копировать только новые файлы.
/C Continues copying even if errors occur.
/D:m-d-y Copies files changed on or after the specified date.
If no date is given, copies only those files whose
source time is newer than the destination time.
/E Copies directories and subdirectories, including empty ones.
xcopy C:\Source Z:\Destination /C /D /E