Коллекции и ссылочные сущности недоступны при построении сущностей, поэтому для коллекций или ссылочных объектов нет частичных методов или переопределений.
Но ...
Вы можете просто добавить свой частичный класс в Getter, который будет возвращать или инициировать вашу бизнес-логику при вызове, поскольку сущность тогда полностью загружена, и на все можно ссылаться как обычно:
public partial class Organization
{
..
..
public bool IsIsoCertified
{
get
{
return CheckIsoCert();
}
}
private bool CheckIsoCert()
{
return this.CertCollection.Contains(Certifications.IsoCertification);
}
..
..