Python 2 и Python 3 достаточно различны, поэтому вы не можете делить модули между ними.Вам понадобятся новые Python-3-совместимые модули вместо повторного использования модулей Python 2.
(Можно с большой осторожностью создать сценарии, которые будут работать в обоих, но обычно это не так.готово. Python 3 был разработан, чтобы быть большой версией, нарушающей синтаксическую совместимость.)