Самым безболезненным будет запуск SSRS в основном режиме, который, как кажется, вы уже делаете, а затем установка веб-частей SSRS на ваш сервер WSS / MOSS.
Вам придется управлять безопасностью и контролировать источники отчетов, используя некоторые другие методы, кроме sharepoint, однако вам не придется устанавливать WSS / MOSS на свой ящик SSRS и добавлять его в свою ферму SharePoint.
Более болезненным вариантом является запуск SSRS в интегрированном режиме. Это позволяет использовать все элементы управления документами SharePoint для отчетов и использовать одни и те же настройки безопасности, однако конфигурация сервера может быть длительной и сложной для настройки.
http://msdn.microsoft.com/en-us/library/bb677365.aspx
Надеюсь, это поможет!
Ben