Я бы начал с изучения нескольких конкретных алгоритмов. Алгоритм Дейкстры и алгоритм закрытия графа - хорошие места для начала. Кроме того, большинство вводных текстов по информатике (например, структуры данных) имеют раздел на графиках. Я использовал эту книгу , в основном после того, как мне было довольно комфортно с большей частью материала. Это довольно формальный подход, поэтому, если у вас сильная математика, она вам может понравиться.
Сообщество, возможно, сможет дать вам лучшие указатели, если вы упомянули что-то конкретное, что вы пытаетесь решить (если есть такая вещь).