Есть ли сборка, на которую я могу ссылаться, которая позволила бы мне запускать собственный экземпляр IIS из моего приложения?
Посмотрите ли вы на Hostable Web Core (HWC) - оболочкой которого является IIS Express - вот пост с некоторыми пояснениями и исходным кодом , возможно, вы можете изменить его под свои нужды ,