Я вижу ту же проблему. Мы использовали мою сборочную коробку для тестирования установок приложения WinForms на машине без 4.0. Мы включили 4.0 в манифест, и приложение работает, Framework 4 Client Profile и Framework 4 Extended отображаются в программах добавления / удаления, но все еще нет 4.0 Framework в опциях VS2010.
Кстати, перезагрузка SP1 не помогла.
Наконец-то я заработал, запустив установку VS2010 в режиме восстановления. Теперь я вижу опции Framework 4.0 в VS2010.
Это был долгий и утомительный процесс, и теперь мне нужно снова исправиться до SP1. MSFT должен исправить это поведение в SP в ближайшее время.