Если ввод представляет собой смесь научных обозначений и явных числовых обозначений, то вы будете писать свой собственный анализатор, который будет считывать числа и отслеживать, какие из них были в каких форматах. Фактически, вы захотите сохранить строковое представление этих чисел, чтобы вы могли написать точно то, что было на входе.
Однако, если вы просто хотите написать write.table () с последовательно явной нотацией, попробуйте.
write.table(format(_your_table_here_, scientific=FALSE), ...)