Новый раздел среды выполнения говорит:
приложение не может записывать данные в локальную файловую систему или устанавливать произвольные сетевые подключения.
Я не уверен, на каком уровне это все еще применяется (учитывая, что прошло 7 лет с тех пор, как вопрос был задан и получен ответ), но мы на Tam успешно использовали драйвер PyMongo в стандартном Google App Engine Python Runtime без проблем. Мы просто следовали официальному уроку PyMongo , и это сработало.