Повторное использование NBM из NetBeans OpenGL Pack должно работать как минимум для NetBeans 7.1. Посмотрите на этот пост: http://netbeans.dzone.com/nb-getting-started-jogl.
Если вы используете Maven, быстрое решение - создать модуль-обертку для JOGL и Gluegen со следующими зависимостями:
<dependencies>
<dependency>
<groupId>org.jogamp.jogl</groupId>
<artifactId>jogl-all-main</artifactId>
<version>2.0-rc9</version>
</dependency>
<dependency>
<groupId>org.jogamp.gluegen</groupId>
<artifactId>gluegen-rt-main</artifactId>
<version>2.0-rc9</version>
</dependency>
</dependencies>
К конфигурации nbm-maven-plugin
необходимо добавить следующие общие определения пакетов:
<publicPackages>
<publicPackage>com.jogamp.*</publicPackage>
<publicPackage>javax.media.*</publicPackage>
<publicPackage>jogamp.*</publicPackage>
</publicPackages>
Полагаю, модуль обертки можно создать из IDE NetBeans, хотя я этого не пробовал.