Действительно, я исследовал документацию по AIR 1.5 и, похоже, они исключили какой-либо доступ к файловым каналам stdin, stdout, stderr - несмотря на то, что они доступны на всех платформах, которые поддерживает AIR.
Полагаю, мысль заключается в том, что приложению с графическим интерфейсом не нужно беспокоиться о чем-то, что обычно связано с программами командной строки. Тем не менее, для родительского процесса, для двунаправленного взаимодействия с дочерним процессом, такие каналы вполне подойдут (я написал множество программ многопроцессорной обработки perl, которые работают таким образом).
Библиотека мостов Merapi, реализованная через межпроцессные каналы stdin, stdout, stderr, предоставит AIR оттенок возможности Microsoft PowerShell (которая может маршалировать объекты .NET через межпроцессные каналы std).