Ну, так как make не будет ничего делать, если ничего не изменилось, как насчет
while true; do sleep 60; make html; done
или эквивалент в выбранной вами оболочке? Я не думаю, что обычные слои файловой системы управляются событиями таким образом, что вы будете уведомлять вас об изменениях файлов, не делая ничего подобного сами, но, возможно, DBUS может делать такие вещи.