Да, вы можете сделать это, используя более одной платформы.Хитрость в правильности, хотя, вы не можете инициализировать настройки из шаблона проекта.Лучше всего начать проект с шаблона проекта SmartDevice, так как он имеет самые пользовательские настройки.Затем Build + Configuration Manager, Платформа активного решения = Новая и выберите Тип = Win32, Копировать = Нет.
Этот последний бит является болезненным, вам придется самостоятельно изменять специфические настройки Win32.Лучше всего открыть образец Win32 .vcproj в текстовом редакторе и проверить его настройки.Таким образом, вы можете воспроизвести их в своем собственном проекте.Кстати, копирование и вставка - самый быстрый и безопасный способ.