Загрузка AJAX отфильтрует все, что не находится в элементе body. Вы можете поместить теги CSS / Javascript в тело, и они будут добавлены на вашу страницу, но я бы избегал этого, если это вообще возможно. Если вы не будете осторожны, вы в конечном итоге включите вещи несколько раз.
Я предлагаю разместить на странице, содержащей вкладки, такие общие элементы, как сам jQuery, плагины и т. Д., И размещать сценарии, специфичные для вкладок, только в тех битах, которые загружаются через AJAX. Вы должны быть осторожны при управлении идентификаторами - они должны быть глобально уникальными, а не уникальными на вкладке. Придерживаться классов - это лучший способ справиться с этим или предварять ваши идентификаторы именем вкладки. Для CSS я постараюсь сделать так, чтобы CSS применялся ко всей странице, включая вкладки, и загружал ее вместе со страницей.
YMMV.