Основная цель этого ответа - сравнить скорости различных версий Python, найденных здесь, но у меня также есть несколько собственных вкладов. (FWIW, я только что обнаружил этот вопрос при выполнении поиска дубликатов).
Относительные скорости выполнения алгоритмов, реализованных в CPython, могут отличаться от тех, которые можно ожидать от простого анализа алгоритмов и опыта работы с другими языками. Это потому, что Python предоставляет множество мощных функций и методов, реализованных в C, которые могут работать со списками и другими коллекциями со скоростью, близкой к скорости, которую можно получить на полностью скомпилированном языке, поэтому эти операции выполняются намного быстрее, чем эквивалентные алгоритмы, реализованные «вручную» с Python. код.
Код, использующий преимущества этих инструментов, часто может превзойти теоретически превосходные алгоритмы, которые пытаются делать все с помощью операций Python над отдельными элементами коллекции. Конечно, фактическое количество обрабатываемых данных также влияет на это. Но для небольших объемов данных код, использующий алгоритм O (n²), работающий на скорости C, может легко превзойти алгоритм O (n log n), который выполняет основную часть своей работы с отдельными операциями Python.
Многие из опубликованных ответов на этот вопрос подсчета инверсий используют алгоритм, основанный на сортировке слиянием. Теоретически это хороший подход, если только размер массива не очень мал. Но встроенный в Python TimSort (гибридный алгоритм стабильной сортировки, полученный из сортировки слиянием и сортировкой вставок) работает на скорости C, и сортировка слиянием, написанная вручную в Python, не может рассчитывать на конкуренцию за скорость.
Одно из наиболее интригующих решений здесь, в ответе, опубликованном Niklas B , использует встроенную сортировку для определения ранжирования элементов массива и Двоичное индексированное дерево (также известное как дерево Фенвика) для хранения совокупных сумм, необходимых для расчета числа инверсий. Пытаясь понять эту структуру данных и алгоритм Никласа, я написал несколько собственных вариаций (опубликовано ниже). Но я также обнаружил, что для умеренных размеров списка на самом деле быстрее использовать встроенную функцию Python sum
, чем красивое дерево Фенвика.
def count_inversions(a):
total = 0
counts = [0] * len(a)
rank = {v: i for i, v in enumerate(sorted(a))}
for u in reversed(a):
i = rank[u]
total += sum(counts[:i])
counts[i] += 1
return total
В конце концов, когда размер списка становится около 500, аспект O (n²) вызова sum
внутри этого цикла for
поднимает свою уродливую голову, и производительность начинает резко падать.
Mergesort - не единственная сортировка O (nlogn), и некоторые другие могут использоваться для подсчета инверсии. ответ prasadvk использует сортировку двоичного дерева, однако его код, по-видимому, находится на C ++ или одном из его производных. Итак, я добавил версию Python. Первоначально я использовал класс для реализации узлов дерева, но обнаружил, что dict заметно быстрее. В конце концов я использовал список, который еще быстрее, хотя он делает код немного менее читабельным.
Одним из преимуществ сортировки деревьев является то, что намного проще реализовать итеративно, чем слиянием. Python не оптимизирует рекурсию и имеет предел глубины рекурсии (хотя он может быть увеличен, если вам действительно нужно ). И, конечно, вызовы функций Python относительно медленные, поэтому, когда вы пытаетесь оптимизировать скорость, полезно избегать вызовов функций, когда это практически возможно.
Еще одна разновидность O (nlogn) - почтенная сортировка radix. Большим преимуществом является то, что он не сравнивает ключи друг с другом. Недостатком является то, что он лучше всего работает с последовательными последовательностями целых чисел, в идеале - с перестановкой целых чисел в range(b**m)
, где обычно b
- 2. Я добавил несколько версий, основанных на сортировке по основанию после попытки чтения Подсчет инверсий, в автономном режиме Подсчет ортогонального диапазона и связанные с ним проблемы , который связан с вычислением количества «инверсий» в перестановке .
Чтобы эффективно использовать радикальную сортировку для подсчета инверсий в общей последовательности seq
длины n, мы можем создать перестановку range(n)
, которая имеет то же количество инверсий, что и seq
. Мы можем сделать это за (в худшем случае) O (nlogn) время через TimSort. Хитрость заключается в том, чтобы переставить индексы seq
, отсортировав seq
. Проще объяснить это небольшим примером.
seq = [15, 14, 11, 12, 10, 13]
b = [t[::-1] for t in enumerate(seq)]
print(b)
b.sort()
print(b)
выход
[(15, 0), (14, 1), (11, 2), (12, 3), (10, 4), (13, 5)]
[(10, 4), (11, 2), (12, 3), (13, 5), (14, 1), (15, 0)]
Сортировав пары (значение, индекс) по seq
, мы переставили индексы seq
с тем же числом перестановок, которое требуется для помещения seq
в исходный порядок из его отсортированного порядка. Мы можем создать эту перестановку, отсортировав range(n)
с подходящей ключевой функцией:
print(sorted(range(len(seq)), key=lambda k: seq[k]))
выход
[4, 2, 3, 5, 1, 0]
Мы можем избежать этого lambda
, используя seq
s .__getitem__
метод:
sorted(range(len(seq)), key=seq.__getitem__)
Это только немного быстрее, но мы ищем все улучшения скорости, которые мы можем получить. ;)
Приведенный ниже код выполняет timeit
тесты всех существующих алгоритмов Python на этой странице, а также несколько моих собственных: несколько версий с грубой силой O (n²), несколько вариантов по алгоритму Никласа Б. и, конечно, по алгоритму слияния (который я написал, не ссылаясь на существующие ответы). Он также содержит мой основанный на списке древовидный код, примерно полученный из кода prasadvk, и различные функции, основанные на радикальной сортировке, некоторые используют стратегию, аналогичную подходам слияния, а некоторые используют sum
или дерево Фенвика.
Эта программа измеряет время выполнения каждой функции в последовательности случайных списков целых чисел; он также может проверить, что каждая функция дает те же результаты, что и другие, и что она не изменяет список ввода.
Каждый timeit
вызов дает вектор, содержащий 3 результата, которые я сортирую. Основное значение, которое следует здесь рассмотреть, - это минимальное значение, остальные значения просто указывают на то, насколько надежным является это минимальное значение, как описано в примечании в модульной документации timeit
.
К сожалению, вывод этой программы слишком велик, чтобы включить его в этот ответ, поэтому я публикую его в его собственном ответе (вики) от сообщества .
Вывод из 3 запусков на моей старой 32-битной одноядерной машине с частотой 2 ГГц, работающей на Python 3.6.0, в старом дистрибутиве, производном от Debian. YMMV. Во время тестов я закрыл свой веб-браузер и отключился от маршрутизатора, чтобы минимизировать влияние других задач на процессор.
При первом запуске проверяются все функции с размерами списка от 5 до 320, с размерами цикла от 4096 до 64 (поскольку размер списка удваивается, размер цикла уменьшается вдвое). Случайный пул, используемый для построения каждого списка, вдвое меньше самого списка, поэтому мы можем получить лотов дубликатов. Некоторые из алгоритмов подсчета инверсий более чувствительны к дубликатам, чем другие.
Во втором прогоне используются большие списки: от 640 до 10240 и фиксированный размер цикла 8. Чтобы сэкономить время, он исключает некоторые из самых медленных функций из тестов. Мои функции грубой силы O (n²) просто way слишком медленны при этих размерах, и, как упоминалось ранее, мой код, использующий sum
, который хорошо работает с небольшими или умеренными списками, просто может ' не отставать от больших списков.
Финальный прогон охватывает список размером от 20480 до 655360 и фиксированный размер цикла 4 с 8 самыми быстрыми функциями. Для списков размером до 40 000 или около того код Тима Бабича является явным победителем. Молодец, Тим! Код Никласа Б также является хорошим универсальным исполнителем, хотя он побежден в меньших списках. Код "python", основанный на делении пополам, также работает довольно хорошо, хотя кажется, что он немного медленнее с огромными списками с большим количеством дубликатов, вероятно, из-за того, что он использует линейный цикл while
, чтобы перешагнуть через дубликаты.
Однако для очень больших размеров списка алгоритмы на основе деления пополам не могут конкурировать с истинными алгоритмами O (nlogn).
#!/usr/bin/env python3
''' Test speeds of various ways of counting inversions in a list
The inversion count is a measure of how sorted an array is.
A pair of items in a are inverted if i < j but a[j] > a[i]
See /375529/podschet-inversii-v-massive
This program contains code by the following authors:
mkso
Niklas B
B. M.
Tim Babych
python
Zhe Hu
prasadvk
noman pouigt
PM 2Ring
Timing and verification code by PM 2Ring
Collated 2017.12.16
Updated 2017.12.21
'''
from timeit import Timer
from random import seed, randrange
from bisect import bisect, insort_left
seed('A random seed string')
# Merge sort version by mkso
def count_inversion_mkso(lst):
return merge_count_inversion(lst)[1]
def merge_count_inversion(lst):
if len(lst) <= 1:
return lst, 0
middle = len(lst) // 2
left, a = merge_count_inversion(lst[:middle])
right, b = merge_count_inversion(lst[middle:])
result, c = merge_count_split_inversion(left, right)
return result, (a + b + c)
def merge_count_split_inversion(left, right):
result = []
count = 0
i, j = 0, 0
left_len = len(left)
while i < left_len and j < len(right):
if left[i] <= right[j]:
result.append(left[i])
i += 1
else:
result.append(right[j])
count += left_len - i
j += 1
result += left[i:]
result += right[j:]
return result, count
# . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
# Using a Binary Indexed Tree, aka a Fenwick tree, by Niklas B.
def count_inversions_NiklasB(a):
res = 0
counts = [0] * (len(a) + 1)
rank = {v: i for i, v in enumerate(sorted(a), 1)}
for x in reversed(a):
i = rank[x] - 1
while i:
res += counts[i]
i -= i & -i
i = rank[x]
while i <= len(a):
counts[i] += 1
i += i & -i
return res
# . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
# Merge sort version by B.M
# Modified by PM 2Ring to deal with the global counter
bm_count = 0
def merge_count_BM(seq):
global bm_count
bm_count = 0
sort_bm(seq)
return bm_count
def merge_bm(l1,l2):
global bm_count
l = []
while l1 and l2:
if l1[-1] <= l2[-1]:
l.append(l2.pop())
else:
l.append(l1.pop())
bm_count += len(l2)
l.reverse()
return l1 + l2 + l
def sort_bm(l):
t = len(l) // 2
return merge_bm(sort_bm(l[:t]), sort_bm(l[t:])) if t > 0 else l
# . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
# Bisection based method by Tim Babych
def solution_TimBabych(A):
sorted_left = []
res = 0
for i in range(1, len(A)):
insort_left(sorted_left, A[i-1])
# i is also the length of sorted_left
res += (i - bisect(sorted_left, A[i]))
return res
# Slightly faster, except for very small lists
def solutionE_TimBabych(A):
res = 0
sorted_left = []
for i, u in enumerate(A):
# i is also the length of sorted_left
res += (i - bisect(sorted_left, u))
insort_left(sorted_left, u)
return res
# . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
# Bisection based method by "python"
def solution_python(A):
B = list(A)
B.sort()
inversion_count = 0
for i in range(len(A)):
j = binarySearch_python(B, A[i])
while B[j] == B[j - 1]:
if j < 1:
break
j -= 1
inversion_count += j
B.pop(j)
return inversion_count
def binarySearch_python(alist, item):
first = 0
last = len(alist) - 1
found = False
while first <= last and not found:
midpoint = (first + last) // 2
if alist[midpoint] == item:
return midpoint
else:
if item < alist[midpoint]:
last = midpoint - 1
else:
first = midpoint + 1
# . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
# Merge sort version by Zhe Hu
def inv_cnt_ZheHu(a):
_, count = inv_cnt(a.copy())
return count
def inv_cnt(a):
n = len(a)
if n==1:
return a, 0
left = a[0:n//2] # should be smaller
left, cnt1 = inv_cnt(left)
right = a[n//2:] # should be larger
right, cnt2 = inv_cnt(right)
cnt = 0
i_left = i_right = i_a = 0
while i_a < n:
if (i_right>=len(right)) or (i_left < len(left)
and left[i_left] <= right[i_right]):
a[i_a] = left[i_left]
i_left += 1
else:
a[i_a] = right[i_right]
i_right += 1
if i_left < len(left):
cnt += len(left) - i_left
i_a += 1
return (a, cnt1 + cnt2 + cnt)
# . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
# Merge sort version by noman pouigt
# From https://stackoverflow.com/q/47830098
def reversePairs_nomanpouigt(nums):
def merge(left, right):
if not left or not right:
return (0, left + right)
#if everything in left is less than right
if left[len(left)-1] < right[0]:
return (0, left + right)
else:
left_idx, right_idx, count = 0, 0, 0
merged_output = []
# check for condition before we merge it
while left_idx < len(left) and right_idx < len(right):
#if left[left_idx] > 2 * right[right_idx]:
if left[left_idx] > right[right_idx]:
count += len(left) - left_idx
right_idx += 1
else:
left_idx += 1
#merging the sorted list
left_idx, right_idx = 0, 0
while left_idx < len(left) and right_idx < len(right):
if left[left_idx] > right[right_idx]:
merged_output += [right[right_idx]]
right_idx += 1
else:
merged_output += [left[left_idx]]
left_idx += 1
if left_idx == len(left):
merged_output += right[right_idx:]
else:
merged_output += left[left_idx:]
return (count, merged_output)
def partition(nums):
count = 0
if len(nums) == 1 or not nums:
return (0, nums)
pivot = len(nums)//2
left_count, l = partition(nums[:pivot])
right_count, r = partition(nums[pivot:])
temp_count, temp_list = merge(l, r)
return (temp_count + left_count + right_count, temp_list)
return partition(nums)[0]
# . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
# PM 2Ring
def merge_PM2R(seq):
seq, count = merge_sort_count_PM2R(seq)
return count
def merge_sort_count_PM2R(seq):
mid = len(seq) // 2
if mid == 0:
return seq, 0
left, left_total = merge_sort_count_PM2R(seq[:mid])
right, right_total = merge_sort_count_PM2R(seq[mid:])
total = left_total + right_total
result = []
i = j = 0
left_len, right_len = len(left), len(right)
while i < left_len and j < right_len:
if left[i] <= right[j]:
result.append(left[i])
i += 1
else:
result.append(right[j])
j += 1
total += left_len - i
result.extend(left[i:])
result.extend(right[j:])
return result, total
def rank_sum_PM2R(a):
total = 0
counts = [0] * len(a)
rank = {v: i for i, v in enumerate(sorted(a))}
for u in reversed(a):
i = rank[u]
total += sum(counts[:i])
counts[i] += 1
return total
# Fenwick tree functions adapted from C code on Wikipedia
def fen_sum(tree, i):
''' Return the sum of the first i elements, 0 through i-1 '''
total = 0
while i:
total += tree[i-1]
i -= i & -i
return total
def fen_add(tree, delta, i):
''' Add delta to element i and thus
to fen_sum(tree, j) for all j > i
'''
size = len(tree)
while i < size:
tree[i] += delta
i += (i+1) & -(i+1)
def fenwick_PM2R(a):
total = 0
counts = [0] * len(a)
rank = {v: i for i, v in enumerate(sorted(a))}
for u in reversed(a):
i = rank[u]
total += fen_sum(counts, i)
fen_add(counts, 1, i)
return total
def fenwick_inline_PM2R(a):
total = 0
size = len(a)
counts = [0] * size
rank = {v: i for i, v in enumerate(sorted(a))}
for u in reversed(a):
i = rank[u]
j = i + 1
while i:
total += counts[i]
i -= i & -i
while j < size:
counts[j] += 1
j += j & -j
return total
def bruteforce_loops_PM2R(a):
total = 0
for i in range(1, len(a)):
u = a[i]
for j in range(i):
if a[j] > u:
total += 1
return total
def bruteforce_sum_PM2R(a):
return sum(1 for i in range(1, len(a)) for j in range(i) if a[j] > a[i])
# Using binary tree counting, derived from C++ code (?) by prasadvk
# https://stackoverflow.com/a/16056139
def ltree_count_PM2R(a):
total, root = 0, None
for u in a:
# Store data in a list-based tree structure
# [data, count, left_child, right_child]
p = [u, 0, None, None]
if root is None:
root = p
continue
q = root
while True:
if p[0] < q[0]:
total += 1 + q[1]
child = 2
else:
q[1] += 1
child = 3
if q[child]:
q = q[child]
else:
q[child] = p
break
return total
# Counting based on radix sort, recursive version
def radix_partition_rec(a, L):
if len(a) < 2:
return 0
if len(a) == 2:
return a[1] < a[0]
left, right = [], []
count = 0
for u in a:
if u & L:
right.append(u)
else:
count += len(right)
left.append(u)
L >>= 1
if L:
count += radix_partition_rec(left, L) + radix_partition_rec(right, L)
return count
# The following functions determine swaps using a permutation of
# range(len(a)) that has the same inversion count as `a`. We can create
# this permutation with `sorted(range(len(a)), key=lambda k: a[k])`
# but `sorted(range(len(a)), key=a.__getitem__)` is a little faster.
# Counting based on radix sort, iterative version
def radix_partition_iter(seq, L):
count = 0
parts = [seq]
while L and parts:
newparts = []
for a in parts:
if len(a) < 2:
continue
if len(a) == 2:
count += a[1] < a[0]
continue
left, right = [], []
for u in a:
if u & L:
right.append(u)
else:
count += len(right)
left.append(u)
if left:
newparts.append(left)
if right:
newparts.append(right)
parts = newparts
L >>= 1
return count
def perm_radixR_PM2R(a):
size = len(a)
b = sorted(range(size), key=a.__getitem__)
n = size.bit_length() - 1
return radix_partition_rec(b, 1 << n)
def perm_radixI_PM2R(a):
size = len(a)
b = sorted(range(size), key=a.__getitem__)
n = size.bit_length() - 1
return radix_partition_iter(b, 1 << n)
# Plain sum of the counts of the permutation
def perm_sum_PM2R(a):
total = 0
size = len(a)
counts = [0] * size
for i in reversed(sorted(range(size), key=a.__getitem__)):
total += sum(counts[:i])
counts[i] = 1
return total
# Fenwick sum of the counts of the permutation
def perm_fenwick_PM2R(a):
total = 0
size = len(a)
counts = [0] * size
for i in reversed(sorted(range(size), key=a.__getitem__)):
j = i + 1
while i:
total += counts[i]
i -= i & -i
while j < size:
counts[j] += 1
j += j & -j
return total
# - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
# All the inversion-counting functions
funcs = (
solution_TimBabych,
solutionE_TimBabych,
solution_python,
count_inversion_mkso,
count_inversions_NiklasB,
merge_count_BM,
inv_cnt_ZheHu,
reversePairs_nomanpouigt,
fenwick_PM2R,
fenwick_inline_PM2R,
merge_PM2R,
rank_sum_PM2R,
bruteforce_loops_PM2R,
bruteforce_sum_PM2R,
ltree_count_PM2R,
perm_radixR_PM2R,
perm_radixI_PM2R,
perm_sum_PM2R,
perm_fenwick_PM2R,
)
def time_test(seq, loops, verify=False):
orig = seq
timings = []
for func in funcs:
seq = orig.copy()
value = func(seq) if verify else None
t = Timer(lambda: func(seq))
result = sorted(t.repeat(3, loops))
timings.append((result, func.__name__, value))
assert seq==orig, 'Sequence altered by {}!'.format(func.__name__)
first = timings[0][-1]
timings.sort()
for result, name, value in timings:
result = ', '.join([format(u, '.5f') for u in result])
print('{:24} : {}'.format(name, result))
if verify:
# Check that all results are identical
bad = ['%s: %d' % (name, value)
for _, name, value in timings if value != first]
if bad:
print('ERROR. Value: {}, bad: {}'.format(first, ', '.join(bad)))
else:
print('Value: {}'.format(first))
print()
#Run the tests
size, loops = 5, 1 << 12
verify = True
for _ in range(7):
hi = size // 2
print('Size = {}, hi = {}, {} loops'.format(size, hi, loops))
seq = [randrange(hi) for _ in range(size)]
time_test(seq, loops, verify)
loops >>= 1
size <<= 1
#size, loops = 640, 8
#verify = False
#for _ in range(5):
#hi = size // 2
#print('Size = {}, hi = {}, {} loops'.format(size, hi, loops))
#seq = [randrange(hi) for _ in range(size)]
#time_test(seq, loops, verify)
#size <<= 1
#size, loops = 163840, 4
#verify = False
#for _ in range(3):
#hi = size // 2
#print('Size = {}, hi = {}, {} loops'.format(size, hi, loops))
#seq = [randrange(hi) for _ in range(size)]
#time_test(seq, loops, verify)
#size <<= 1
Пожалуйста, смотрите здесь для вывода