Как извлечь содержимое файла .pdf для дальнейшей манипуляции с использованием PHP?
Вам нужно будет использовать библиотеку PDF, чтобы захватывать и писать материалы для PDF-файлов. Информационный пост о извлечении содержимого из PDF: http://community.livejournal.com/php/295413.html