Ваша проблема в том, что Python ищет этот файл в каталоге Python и не находит его.Вы должны указать, что вы говорите о каталоге, в котором вы находитесь, а не о Python.
Для этого вы измените это:
from application.app.folder.file import func_name
на этот:
from .application.app.folder.file import func_name
Добавляя точку, вы говорите, смотрите в этой папке папку приложения, а не в каталоге Python.