Есть несколько способов сделать это.
Если вы используете Visual Studio 2008 при создании проектов / веб-сайтов, убедитесь, что вы нацелены на .net framework 2.0. Если вы не используете какие-либо элементы управления / расширители в Framework 3.5, вы не будете ссылаться на какие-либо сборки 3.5. Чтобы убедиться в этом, взгляните на файл web.config и решите проблемы.
Я вижу, что вы хотите использовать инструменты moo, вышеупомянутые настройки и jquery для ваших пользовательских вещей javascript должны выполнить вашу работу.
Это все, что я могу сказать по моим знаниям.
Удачного кодирования!