Проблема заключалась в использовании new NorthScaleClient(c).Store(StoreMode.Set, i.ToString(),
reader)
внутри Assert.True
метода.После удаления встроенного вызова и его инициализации извне работает хорошо.Наверное, иногда объект выходит из области видимости и утверждение не выполняется.