Примерно так должно работать:
$this->db->join('B', 'aCol = bCol AND bOtherCol = 0');
$this->db->get('A');
При желании для метода join
может быть указан третий аргумент, указывающий, должно ли выполняться соединение слева или справа.Например, для выполнения левого соединения:
$this->db->join('B', 'aCol = bCol AND bOtherCol = 0', 'left');