Как сказал CMS, YUI-компрессор - отличный инструмент для сжатия и запутывания вашего кода, попробуйте это.
Я использую следующий код в моих файлах JavaScript. Я работаю на OSX, но команда должна быть идентичной в Linux и, возможно, также в Windows (хотя я никогда не пробовал).
java -jar /path/to/yuicompressor-2.4.jar --charset utf8 -o ~/path/to/scriptname.min.js ~/path/to/scriptname.js
Где ~ / path / to / - это путь к файлу javascript, scriptname.min.js - это имя свернутого / скрытого конечного результата, а scriptname.js - исходный файл.
Я полагаю, вы не можете просто "забыть" о IE6? Одно из моих новогодних пожеланий состоит в том, чтобы последние 23% пользователей IE6 в Интернете наконец обновились до более приличного / современного браузера: -).
Надеюсь, это поможет!
-Dave