Прежде всего, вы форматируете из строки, а не из числа (с плавающей или двойной).Попробуйте изменить объявление на:
var number = 0.2343; //this is a double
или, если вы не можете изменить это String , , проанализируйте до float или double :
var number = parseFloat("0.2343"); //this is a float
Затем попробуйте изменить строку формата на ",##0.00"
.У меня это работает:
alert($.formatNumber(number, {format:",##0.00") );